インドのエムポックス症例、Ib型とIIb型の組換え株による最も早い感染例と判明

9月の感染例が明らかにした監視体制の広範な盲点

2025年9月1日、アラビア半島で働いていた男性にエムポックスの症状が現れた。この男性は、エムポックスの2系統、クレードIbとIIbの遺伝物質を含む組換えウイルスの、確認された最も早い感染例と特定された。感染は9月11日にインドで確認されたが、特異な遺伝的構成が明らかになったのは、関連するウイルスが英国で特定され、世界的なデータベースに登録された後だった。

世界保健機関（WHO）によると、インドと英国で確認されたウイルスの遺伝的類似性は99.9％を超えていた。両患者は重症化せずに回復し、いずれの国でも接触者調査で二次感染は確認されなかった。しかし、患者らの渡航歴からは、この株の流行が両国での検出にとどまらないことが示唆される。

WHOはエムポックスの流行に関する通知で、組換え株の感染伝播はすでにWHOの3地域にまたがる少なくとも4カ国に及んでいると評価した。確認された2人の患者はアジアの異なる地域から渡航しており、遺伝的に近縁な感染例は国際的な監視が必要であることを示す兆候となった。

インド医学研究評議会（ICMR）国立ウイルス学研究所（プネー）の研究者が、ケララ州とポンディシェリの臨床機関と連携して実施したインドの調査結果は、『Nature Microbiology』に掲載された。研究者らはウイルスゲノムのほぼ全体を解析し、患者の検体から生きたウイルスを培養した。

直ちに対応すべき実務上の課題も明らかになった。通常の検査でエムポックスは検出されたものの、遺伝的な系統を特定する検査では、インドと英国で当初異なる分類結果が出た。ウイルスのゲノム解析によって両者の関連が判明した。

インドの症例が再分類されるまで

インドの患者は、アラビア半島の国に居住する出稼ぎ労働者だった。同国で発症後にインドへ戻り、PCR検査でサル痘ウイルス感染が確認された。PCR検査はウイルスDNAの一部を検出するもので、エムポックスの診断に用いられる主要な検査法である。

9月15日に実施された追加検査では、当初ウイルスはクレードIIに分類された。遺伝子配列の初期解析でも、2022年に始まった世界的流行の原因となった系統、クレードIIbが示唆された。

転機となったのは2025年12月16日だった。英国で特定された組換え株が世界的なNextcladeデータベースに追加され、インドのウイルスを再評価した結果、同じ組換え株に分類された。インドは2026年1月13日にWHOへ報告した。

この経緯は、インドで確認された感染の方が早かったにもかかわらず、英国が先に株を報告した理由を示している。

• 2025年9月1日：インドの患者が海外滞在中に発症。
• 9月11日：インドでのPCR検査でエムポックス感染を確認。
• 9月15日：クレード識別検査で当初クレードIIと判定。
• 9月29日：治療上の合併症なく回復し、検査で陰性を確認。
• 10月：英国の患者がアジア太平洋地域の国から帰国。
• 12月：英国が組換え株を報告。12月16日にNextcladeへ登録。
• 2026年1月13日：インドが後から特定した組換え株の症例をWHOに報告。

WHOによると、インドの症例の発症日は英国の症例より2カ月以上早かった。組換え株の特定には、患者の症状だけでなく、国境を越えて遺伝子データを照合することが鍵となった。

組換えウイルスとは

サル痘ウイルス（MPXV）には、クレードIとクレードIIという2つの主要な遺伝的グループがある。それぞれIa、Ib、IIa、IIbに細分される。クレードIbは2023年、コンゴ民主共和国の南キブ州で出現し、その後、国際的に広がった。クレードIIbは2022年に始まった世界的流行を引き起こした。

近縁のウイルス2種類が同じ細胞に感染し、複製の過程で遺伝物質を交換すると、組換えが起こることがある。こうして生じたウイルスは、親となったそれぞれのウイルスから受け継いだDNAの領域を含み、以前の2つの版の一部を組み合わせた文書のような構成になる。

ポックスウイルスは二本鎖DNAからなる大きなゲノムを持ち、遺伝物質の交換はその生物学的特性として知られている。今回の症例では、研究者らはクレードIbに関連する領域とクレードIIbに関連する領域が交互に並ぶことを確認した。

インドの解析では、両方の親系統に典型的な変異が1つのゲノム内に並んでいることが確認された。研究者らは個々の領域を参照配列とも比較した。その結果、領域によって異なる親クレードに分類され、ゲノムがモザイク状であるとの見解が裏付けられた。

遺伝子比較で判明したこと

インドの研究チームは、臨床検体と、そこから培養したウイルス分離株の双方から、ゲノムの99％超を解析した。WHOによると、インドと英国の組換えウイルス配列の類似性は99.9％を超え、共通の進化史を持つことが裏付けられた。

インドの研究では、親系統のいずれかから受け継いだ連続した領域を指す「組換え領域」が34カ所、組換え系統に関連する変異が21個確認された。研究報告では英国のウイルスにも34領域があるとされた。一方、WHOの比較では、インドの配列に34領域、英国の配列に28領域があり、そのうち16領域が共通していた。

研究者らは複数の手法で両者の関係を調べた。全ゲノムの比較では、2つの組換え株は親系統の間に位置した。遺伝的ネットワーク分析では箱形のパターンが現れた。これは、DNAの交換を伴い、単一の枝分かれする系統樹では整理しにくい関係を示す手法である。

したがって、最も強い関連が確認されたのは2つのウイルス自体の間である。高い類似性と共通するモザイク構造は、いずれかの国で認識される前から、近縁の組換え系統が流行していたことを裏付けている。

生きたウイルスの培養が重要だった理由

プネーの研究チームはDNAの解析にとどまらなかった。研究者らは臨床検体を、ウイルス学の研究室で一般的に使われるVero CCL-81細胞に接種し、2回目の継代培養の3日目までにウイルス複製に関連する細胞損傷を確認した。この実験を3回繰り返し、一貫した結果を得た。

生きたウイルスを分離できたことで、モザイク状の配列が複製能力を持つウイルスに由来することが、より確かなものとなった。研究チームは臨床検体と分離株の配列を、Pathoplexusや国際塩基配列データベース共同事業（INSDC）に参加するデータベースなど、公開遺伝子データベースに登録した。

英国の研究者らも、調査結果を繰り返し検証した。元の検体、新たに元検体から抽出した試料、同時期に採取した別の綿棒検体、培養した分離株のそれぞれから配列を決定した。いずれも同一のウイルスゲノム配列が得られた。

生きたウイルス分離株は、次の段階の研究に必要な試料を研究機関に提供する。ウイルスの増殖速度、抗ウイルス薬への反応、抗体による認識のされ方などを調べられる。英国当局は組換え株の生物学的特性に関する研究を続けている。

通常の検査で異なる分類が出た理由

インドのウイルスは当初クレードIIに、英国のウイルスは当初クレードIbに分類された。その後、どちらもゲノム配列解析により、互いに近縁な組換え株と特定された。

診断用PCR検査では、選択された短い遺伝物質の領域を調べる。クレード識別検査では、ウイルスのグループを区別するための目印を調べる。組換え株がゲノムの一部にクレードIbの目印を持ち、別の領域にクレードIIbの遺伝物質を含んでいる場合、検査結果の分類は検査対象となる領域によって変わり得る。

検査機関にとっては、病気の診断とウイルスの正確な分類を区別する必要がある。両患者ともエムポックス感染が確認されていたが、より詳細な遺伝的分類には追加解析が必要だった。

WHOは、クレード識別PCR検査だけでは組換え株を確実に特定できない場合があるとしている。インドでは、オルソポックスウイルスとMPXVの一般検査に続いてクレード識別検査を行い、陽性例の配列を決定する。英国では、クレードIbと判定された全検体と、クレードIIbと判定された検体の一部で配列を決定している。

インドの研究者らは、組換え株が疑われる場合の調査手順を示した。クレード検査で予想外の結果が出たり、結果に食い違いがあったりした場合は、全ゲノムを調べる理由となる。また、新たに認識された株が共有データベースに登録された後、過去の配列を再検討する重要性も示された。

回復した2人の患者と、より広範な地域への広がりを示す兆候

インドの患者は入院後、合併症なく回復し、9月29日に検査で陰性となった。インド国内で濃厚接触者はいなかったと本人は報告し、保健当局も二次感染を確認しなかった。

英国の患者も重症化しなかった。少数の接触者を追跡したが、エムポックスの症状が現れた人はいなかった。患者を担当した医療従事者は完全な個人用防護具を着用していた。接触者には助言が行われ、ワクチン接種が提案され、症状の有無が監視された。

WHOが少なくとも4カ国への感染の広がりを推定したのは、検出された2カ国と患者らの渡航歴を合わせて判断したためだ。株の起源、感染例を結び付ける経路、感染や重症度への生物学的影響は、依然として分かっていない。

両患者の症状は、他のクレードによるエムポックスと一致していた。WHOは公衆衛生上のリスク評価を変更していない。新たな相手や複数の相手と性交渉を持つ男性、セックスワーカー、または複数の相手と不特定の性交渉を持つ人々については「中程度」、特定のリスク要因がない一般の人々については「低い」としている。

感染リスクのある人にとっての意味

エムポックスは主に、性的接触を含む濃厚な身体接触を通じて感染し、汚染された物を介して広がることもある。症状には、発熱、リンパ節の腫れ、皮膚や粘膜の病変などがある。病変が数個だけしか現れない人もおり、早期の発見が難しくなる場合がある。

英国保健安全保障庁（UKHSA）で性感染症対策を統括するケイティ・シンカ氏は、ウイルスの変化を早期に検出する手段としてゲノム検査の重要性を強調している。また、エムポックスは重症化することもあるとして、接種対象者にワクチン接種を呼びかけている。

英国の定期ワクチン接種プログラムは、複数の性的パートナーがいる人やグループセックスに参加する人など、感染リスクの高い対象者を主な対象としている。接種指針で引用された研究によると、クレードIIに対する予防効果は約75～80％で、クレードIbに対しても効果が期待される。組換え株が免疫にどう反応するかを調べる研究も、今後必要な実験室での検証の一つだ。

2024年10月以降、クレードIbの感染はロンドン、イーストサセックス、リーズ、イングランド北東部で確認され、一部の集団発生では世帯内の限られた感染も起きている。クレードIbの感染を報告した他の国には、米国、スペイン、イタリア、オランダ、ポルトガルがある。こうした検出例は、確認された2件の組換え株症例とともに、より広範な監視の背景をなしている。

WHOは引き続き、感染リスクのある人へのワクチン接種、迅速な診断、適切な臨床治療、感染対策を推奨している。また、エムポックス関連の医療サービスをHIVや性感染症の診療に統合し、必要に応じて早期のHIV検査と治療へのアクセスを確保することも推奨している。

WHOが検査機関に求める次の対応

WHOは、流行の初期段階では確認された全症例の検体について配列を決定するよう推奨している。市中感染が定着した場合は、確認症例の少なくとも10％、つまり10人に1人以上に相当する代表的な検体の配列決定を推奨する。

輸入感染例、異例または重症の症例、渡航歴に関連する症例は、より詳しい遺伝子解析の優先対象となる。配列を速やかに共有することで、他国の検査機関が新たな知見を比較し、インドの検体で起きたように、過去の分類を見直せる。

WHOは渡航に関する助言を次のように示した。

WHOは、ここで報告した事例に関して入手可能な情報に基づき、本報告書に記載された国への渡航または同国との貿易に制限を設けないよう勧告する。

WHOのテドロス・アダノム事務局長は2025年9月5日、エムポックスが「国際的に懸念される公衆衛生上の緊急事態」ではなくなったと発表した。2026年8月まで延長された既存の勧告に基づき、監視と対応は引き続き求められている。

インドの事例は、こうした対応が具体的に何をもたらすかを示している。患者は臨床治療を受けて回復し、通常検査でエムポックスが検出された。配列解析によって特異なゲノムが捉えられ、国際データベースの更新により、正確な分類に必要な関連性が明らかになった。

要点

• インドの患者は2025年9月1日に発症し、Ib型とIIb型の組換え株による感染例として、最も早い確認例となった。
• インドと英国のウイルス配列は99.9％を超える類似性を示し、共通の進化史を持つことが裏付けられた。
• 両患者は重症化せずに回復し、接触者調査でも二次感染は確認されなかった。
• 当初のクレード検査では異なる分類が出たが、ゲノム配列解析により組換え株の関連性が明らかになった。
• WHOは、この株の感染伝播が3地域の少なくとも4カ国に及んでいると評価している。
• WHOのリスク評価に変更はなく、配列解析の継続、感染リスクのある人へのワクチン接種、渡航・貿易制限を設けないことを推奨している。